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Citometria

Attrezzature e metodi



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Metodiche

  • Analisi dell'instabilità genomica mediante la misura del DNA index con metodi di citometria a flusso multiparametrica in campioni bioptici ottenuti da lesioni predisponenti e preneoplastiche dei tumori dell'apparato digerente e del cavo orale
  • Analisi delle mutazioni dei geni KRAS2 e APC mediante PCR e sequenziamento in adenomi ed adenocarcinomi colorettali umani
  • Analisi del fenotipo MSI negli adenocarcinomi colorettali umani sporadici
  • Analisi dell'espressione genica con metodiche convenzionali e DNA microarrays per trattamenti in vitro con farmaci tradizionali e biologici mediante l'uso di linee cellulari tumorali colorettali e del cavo orale transfettate con diversi costrutti di KRAS2 e APC
  • Analisi di eventi precoci (variazione del potenziale di membrana mitocondriale) e tardivi (frammentazione del DNA) dell'apoptosi mediante metodi flussocitometrici (TMRM, JC-1, TUNEL)
  • Analisi dell'espressione di proteine associate al ciclo cellulare e all'apoptosi attraverso metodi flussocitometrici e Western Blotting
  • Analisi della cinetica del ciclo cellulare con metodi flussocitometrici associati all'incorporazione di bromodesossiuridina
  • Sorting di popolazioni di nuclei DNA diploidi e aneuploidi ottenute da campioni bioptici o prelievi secondo la tecnica dello "strato sottile" di regioni del cavo orale definite quali leucoplachie
  • Estrazione di DNA da nuclei sortati e non sortati, colorati con DAPI anche a partire da popolazioni di 20-100.000 nuclei
  • Amplificazione del DNA genomico umano intero a partire da poche decine di nanogrammi, per successive analisi molecolari
  • Analisi di aberrazioni cromosomiche numeriche e strutturali mediante tecniche di citogenetica molecolare (FISH e CGH)

Attrezzature

  • Citometro a flusso di ultima generazione, dotato di tre laser e una lampada UV per l'acquisizione di 10 parametri ottici
  • Cell sorter (FACS). Sorter di nuova generazione costituito da Citometro a flusso, dotato di un diodo UV, collegato ad una unità sortante PPCS che si avvale di un sistema piezoeletrico per la separazione fisica delle particelle senza creazione di aerosol potenzialmente pericolosi
  • Microscopio a fluorescenza
  • Microscopio ottico a luce bianca
  • Termociclatore
  • Altre dotazioni per analisi di mutazioni
  • Sistemi per elettroforesi orizzontali e verticali
  • Incubatore a CO2
  • Centrifuga refrigerata
  • Centrifuga da banco
  • Cappa biohazard
  • Cappa chimica
  • Congelatori (-20°C e -80°C) e frigoriferi da laboratorio
  • Contenitore azoto liquido
  • Bagno sonicatore a ultrasuoni
  • Stufa da laboratorio
  • Bagni termostatici
  • Bilancia analitica
  • Bilancia tecnica
  • Oscilloscopio
  • Autoclave da banco


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