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Metodiche
- Calorimetria differenziale a scansione per la caratterizzazione termodinamica delle
transizioni conformazionali della cromatina nucleare (Fig. 4). Questa tecnica,
messa a punto dal nostro gruppo in collaborazione con l'ISMAC-CNR alcuni anni fa, permette di distinguere e
quantificare in situ l'eu e l'eterocromatina ed è stata applicata con successo dal nostro e da altri
laboratori per lo studio del processo di trasformazione in vivo ed in vitro e per lo studio dei dettagli
locali dell'interazione DNA-istoni.
- Elettroforesi bidimensionale ad alta risoluzione applicata a studi di proteomica
differenziale (Fig. 1, Fig. 2 e Fig. 5).
Con questa tecnica e l'impiego di programmi di analisi di immagine specifici è stato
possibile identificare le classi di proteine che vengono espresse in modo differente durante il processo di
trasformazione, alcune delle quali hanno mostrato un significativo potenziale prognostico sia per i tumori
della prostata che della vescica.
- Tecniche di Western e Southwestern blot per l'identificazione delle proteine in grado di
legare le sequenze MARs (Fig. 3) allo scopo di
valutare le eventuali alterazioni nei tessuti normali e in quelli trasformati, soprattuto nelle fasi
precoci del processo di cancerogenesi.
- Analisi di immagine per la valutazione di parametri morfologici e morfometrici e per lo
studio dell'espressione differenziale di proteine nucleari in tessuti normali e tumorali con tecniche di
immunoelettromicroscopia (Fig. 6) e microscopia confocale
(Fig. 7).
- Produzione e caratterizzazione di anticorpi monoclonali diretti contro proteine della
matrice nucleare.
- Estrazione, purificazione e caratterizzazione dei componenti nucleari quali: cromatina
ad alto peso molecolare, nucleosoma, core particle, istoni e proteine della matrice nucleare.
Attrezzature
- Calorimetro differenziale a scansione
- Laboratorio attrezzato per colture cellulari.
- Fotomicroscopio per analisi in campo chiaro, contrasto di fase ed epifluorescenza
collegato con telecamere B/N e a colori per l'analisi di immagine
- Attrezzatura completa per elettroforesi monodimensionale.
- Attrezzatura per elettroforesi bidimensionale ad alta risoluzione con l'impiego di
immobiline
- Attrezzatura completa per Western e Southwestern blotting di gels mono e
bidimensionali
- Attrezzatura per elettroforesi bidimensionale
- Attrezzatura per elettroforesi su gel di agarosio in campo continuo o pulsato
- Cappe chimiche
- Congelatori -80°C
- Contenitore azoto liquido per la crioconservazione di cellule e di materiale biologico
- Centrifughe refrigerate
- Criostato
Attraverso la convenzione con l'ISMAC-CNR
sono inoltre disponibili:
- Microscopio elettronico a trasmissione
- Ultra microtomo
- Spettropolarimetro
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Presentazione della struttura